"연말정산 공제 실수, 종합소득세 신고로 해결하세요~"

국세청, 연말정산한 근로자에게 부양가족 공제 오류 최초로 개별 안내
잘못 공제·감면 받은 근로자 6.1.까지 종합소득세 신고로 정정 가능
나홍선 기자 | hsna@joseplus.com | 입력 2026-05-14 12:00:52
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국세청은 14, 이번 종합소득세 신고를 맞아 근로자가 연말정산할 때 잘못 신고한 부분을 가산세 없이 바로잡을 수 있는 방법을 아래와 같이 안내한다고 밝혔다.

 

 연말정산 때 미처 못 받은 공제가 있는 경우

 

근로자가 연말정산할 때 놓친 공제 및 감면이 있다면 종합소득세 신고기간(5.1.~6.1.) 동안 종합소득세 신고*를 통해 반영하면 된다.

 

*[경로] 홈택스로그인세금신고종합소득세 신고근로소득 신고정기 신고

 

공제를 추가 반영하여 발생한 환급금*은 신고기한(6.1.)으로부터 30일 내에 종합소득세 신고서에 기재한 근로자 본인 명의 계좌로 지급된다.

 

*지방소득세는 종합소득세 환급 후 4주 이내에 관할 지방자치단체를 통해 지급

 

 연말정산 때 더 많이 받은 공제가 있는 경우

 

연말정산할 때 공제감면을 잘못 신고하여 소득세를 적게 낸 근로자는 종합소득세 신고기간 동안 잘못된 부분을 정정하여 신고하면 된다.

 

근로자가 종합소득세 신고기간에 잘못을 정정하지 않으면, 국세청이 하반기에 실시하는 과다공제 점검과정에서 적게 낸 세금뿐만 아니라 각종 가산세*까지 부담해야 할 수 있다. 

 

*과소신고가산세 : 적게 신고한 세액의 10%(부정행위로 적게 신고한 경우 40%) 부과
납부지연가산세 : 적게 납부한 세액에 대해 1일당 22/100,000 부과

 

 부양가족 공제 오류, 근로자 개별 안내 최초 실시

 

국세청은 연말정산 자료를 신속히 분석하여, 매년 사후적으로 점검해 왔던 공제 오류 중 일부를 근로자에게 미리 안내*한다.(5.15.)

 

* (1차 발송) 카카오톡, (1차 발송 실패시) 네이버 알림으로 안내문 발송

 

이번에 안내되는 공제 오류는 동일한 부양가족을 중복하여 공제받은 경우, 사망한 자 또는 무관계자를 부양가족으로 공제받은 경우이다.

 

부양가족 공제 오류 모바일 안내문을 받은 근로자는 홈택스*를 통해 상세한 내용을 확인할 수 있고, 잘못 신고된 공제내용은 종합소득세 신고기간 동안 가산세 없이 정정할 수 있다.

 

*[경로] 홈택스 로그인장려금·연말정산·기부금연말정산간소화소득·세액공제 자료 조회

 

<신고 유의사항>

 

 

 

공제 오류로 확인된 부양가족은 인적공제뿐만 아니라, 해당 부양가족의 보험료, 의료비, 교육비, 기부금, 신용카드 등 사용금액도 공제대상에 해당하지 않으므로, 종합소득세 신고시 반드시 제외해야 한다.

 

 여러 소득이 있거나 2개 이상의 회사에서 근무한 경우

 

’25년 중 근로소득 외에 사업기타소득, 2천만원 이상의 이자배당소득이 있다면 해당 소득과 근로소득을 합산하여 종합소득세 신고를 해야 한다.

 

또한, ’25년 중 이직 등으로 2개 이상의 회사에서 급여를 받은 근로자가 주된 근무지에서 연말정산할 때 합산 신고하지 않았다면, 각 회사별로 원천징수영수증을 확인하여 종합소득세 신고기간에 합산 신고해야 한다.

 

근로자가 회사별로 연말정산을 이행하였다고 해도 합산하여 신고하지 않을 경우에는 무신고가산세, 납부지연가산세가 부과될 수 있다.

 

앞으로도 국세청은 납세자의 세부담이 최소화되도록 부양가족 공제 오류뿐만 아니라, 각종 공제 오류에 대한 사전 안내를 확대해 나갈 계획이다.

 

국세청 누리집의 연말정산 종합안내*또는 국세상담센터**를 이용하면 각종 공제감면과 관련된 궁금한 사항을 해결할 수 있다.

 

*[경로] 국세청 누리집(www.nts.go.kr)국세신고안내개인·법인신고안내연말정산 종합안내

 

참고 1

 

연말정산 간소화 시스템 팝업창 안내 -국세청 제공-

 

연말정산 부양가족 공제 오류 안내

 

귀하의 근로소득 연말정산 신고내용을 검토한 결과 부양가족 공제에 오류가 있는 것으로 보여 아래와 같이 안내한다.

 

아래의 [연말정산 부양가족 공제 오류 안내자료 확인하기]를 클릭하면 구체적인 내용을 확인하실 수 있다.

 

공제 오류가 맞다면 신고기간(5.1.~6.1.) 동안 아래의 [홈택스 종합소득세 신고 바로가기]를 클릭하여 가산세 부담 없이 정정 신고해야 한다.

 

종합소득세 신고기간에 세무서를 방문하면 대기시간이 100분 이상 소요될 수 있으므로 가급적 홈택스모바일로 신고해야 한다.

 

[종합소득세 신고 경로] 

(홈택스) [공동·금융인증서 또는 간편 인증 로그인] 세금신고 종합소득세 신고 근로소득 신고 정기 신고

 

(모바일) 국세청 모바일 앱(손택스)를 설치하고, [공동·금융인증서 또는 간편 인증 로그인] 전체메뉴 세금신고 종합소득세 신고 근로소득 신고 종합소득세 근로소득 신고(정기신고)

 

안내해 드린 내용과 관련하여 궁금하신 점이나, 추가 상담이 필요한 경우에는 국세상담센터(126)으로 문의해 주기 바람.

 

[국세상담센터 연결 경로] 

12615(연말정산간소화)1(소득공제 요건 등 세법문의)

 

연말정산 부양가족 공제 오류 안내자료 확인하기

홈택스 종합소득세 신고 바로가기

 

참고 2

 

부양가족 공제 오류 안내 유형

 

사례

부양가족 중복공제(1)

 

근로자 본인기본공제대상자에 해당하는 아버지부양가족으로 인적공제 받았으나, 형제지간인 동생 아버지부양가족으로 중복하여 공제

 

 


 

 

사례

부양가족 중복공제(2)

 

근로자 본인기본공제대상자에 해당하는 배우자인적공제 받았으나, 장인(배우자의 직계존속)도 배우자를 부양가족으로 중복하여 공제

 

 


 

 

사례

부양가족 중복공제(3)

 

근로자 본인기본공제대상자에 해당하는 자녀부양가족으로 인적공제 받았으나, 배우자동일 자녀부양가족으로 중복하여 공제

 

 


 

사례

부양가족 사망자 공제

 

근로자 본인’24.12.31. 이전사망어머니부양가족으로 인적공제

 

 


 

인적공제 여부의 판정은 해당 과세기간의 종료일(12.31.) 현재의 상황에 따르며, 과세기간 종료일 전에 사망한 자는 사망일 전날의 상황에 따름

(예시) ’24.12.31. 사망 공제 불가, ’25.1.1. 사망 공제 가능

 

사례

부양가족 무관계자 공제

 

근로자 본인이 공제 대상 부양가족이 아닌 동생의 자녀(조카)부양가족으로 신고하여 인적공제

 

 


 

3 이상 관계 가족(삼촌고모이모조카 등)은 부양가족으로 공제받을 수 없음

  

참고 3

 

연말정산 때 잘못 신고한 주요 사례

 

공제를 적게 받은 사례 

항목

 

공제누락 사례

월세액

세액공제

 

월세액 세액공제 요건을 갖추지 못해 월세에 대한 현금영수증 발급받았지만 신용카드 등 사용금액 소득공제를 누락한 경우

 

월세액 세액공제를 적용받지 못해도 신용카드 등 사용금액 소득공제는 적용 가능(중복으로 공제받을 수는 없음)

기부금

세액공제

 

’24년 이전에 기부하였으나 공제받지 않은 기부금(이월기부금) 있는데도 ’25년 기부금 공제를 받지 않은 경우 또는 기부금 적격단체로부터 종이 기부금 영수증을 받았는데 공제 누락한 경우

장애인

추가공제

 

발달재활서비스를 지원받고 있는 장애아동을 부양하고 있는 부모가 병원으로부터 장애인증명서를 발급받지 못해 자녀의 장애인 추가공제를 누락한 경우

 

’25년부터 장애아동의 증빙인정서류 범위확대하여 장애인증명서이외에 발달재활서비스 이용증명서로도 공제 가능

교육비

세액공제

 

대출받은 대학 등록금(학자금) 상환액을 교육비 공제 누락하거나, 취학 전 아동 학원비 등 수동 증빙을 누락해 공제받지 않은 경우

 

공제를 많이 받은 사례 

항목

 

과다공제 사례

소득기준 초과

부양가족 공제

 

연간 소득금액(근로·사업·양도·퇴직 등) 합계액이 100만원초과하는 부양가족을 인적공제 받은 경우

장기주택저당차입금

이자상환액

소득공제

 

과세연도 종료일(12.31.) 기준 2주택 이상을 보유한 세대에 해당하거나, 주택 취득 시 기준시가 요건*초과하는데도 장기주택저당차입금(주택담보대출) 이자상환액 공제를 적용받은 경우

 

*’24.1.1.이후 취득시 기준시가 6억원 이하 주택만 공제 가능

의료비

세액공제

 

건강보험공단의 본인부담금 상한제 초과환급금 또는 보험회사의 실손의료보험금을 의료비에서 제외하지 않고 세액공제 받은 경우

혼인세액공제

 

’25년 혼인은 하였으나, 혼인신고를 하지 않은 자혼인세액공제를 받은 경우

 

’24~’26년 중 혼인신고한 거주자에 한하여 생애 1회만 적용 가능

 

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